Proceso de Facturación en Servicios de Salud: Guía Paso a Paso en 8 Etapas
Proceso de Facturación en Servicios de Salud: Guía Paso a Paso en 8 Etapas
El proceso de facturación en servicios de salud es el camino que recorre una atención desde que el paciente entra al consultorio hasta que el pagador consigna el dinero. Cuando falla un paso, la cuenta se devuelve, se glosa o se paga tarde, y el flujo de caja de la IPS lo siente.
En esta guía le explicamos, paso a paso y en lenguaje sencillo, cómo funciona el proceso de facturación en salud en Colombia en 2026, qué normas lo regulan y dónde se pierde más dinero.
¿Qué es el proceso de facturación en servicios de salud?
Es el conjunto de actividades para cobrar los servicios prestados a un paciente: registrar la atención, generar la factura electrónica y los RIPS, validarlos, radicar la cuenta con sus soportes y gestionar las respuestas del pagador hasta el pago.
En salud tiene una particularidad: la factura sola no basta. Debe ir acompañada de los RIPS validados por el Ministerio de Salud y de los soportes de cobro que exige la norma.
Normas del proceso de facturación en servicios de salud
| Norma | Qué regula |
|---|---|
| Decreto 441 de 2022 | Los acuerdos de voluntades (contratos) entre pagadores, prestadores y proveedores |
| Resolución 948 de 2026 | Los RIPS como soporte de la factura electrónica, su validación y el CUV |
| Resolución 2284 de 2023 | Los soportes de cobro y el Manual Único de Devoluciones, Glosas y Respuestas |
| Normas de la DIAN | La factura electrónica de venta |
El proceso de facturación en servicios de salud, paso a paso
Paso 1. El contrato
Antes de atender, debe existir un acuerdo de voluntades con el pagador: servicios, tarifas, modalidad de pago y soportes. Con la Resolución 948 de 2026, el contrato tiene un código único (CUCON), que se genera al cargarlo en el SIIFA y acompaña después a la factura.
Paso 2. La admisión
Se verifican los datos del paciente y su afiliación, se confirma la autorización cuando el contrato la exige y se registran los cobros que corresponden en recepción.
Paso 3. La atención y su registro
El profesional registra la atención en la historia clínica: diagnóstico con CIE-10, procedimientos con CUPS, medicamentos y demás tecnologías. Todo lo que se va a cobrar tiene que estar aquí.
Paso 4. La factura electrónica y los RIPS
Se genera la factura electrónica de venta, validada por la DIAN, y los RIPS en formato JSON con el detalle de cada servicio.
Paso 5. La validación ante el Ministerio de Salud
Los RIPS y la factura pasan por el Mecanismo Único de Validación. Si cumplen las reglas, el Ministerio entrega el Código Único de Validación (CUV). Si no, hay que corregir y volver a enviar.
Paso 6. La radicación
Con la factura, los RIPS, el CUV y los soportes de cobro que exige la Resolución 2284 de 2023, la cuenta se presenta al pagador.
Paso 7. Devoluciones, glosas y respuestas
El pagador revisa la cuenta. Puede devolverla o glosarla según las causales del Manual Único de Devoluciones, Glosas y Respuestas. El prestador debe responder dentro de los términos y con los soportes.
Paso 8. El pago y la conciliación
Se paga lo aceptado y se concilian las diferencias. Una cartera bien documentada facilita este paso.
Dónde se pierde dinero en el proceso de facturación en servicios de salud
| Problema | Consecuencia | Cómo evitarlo |
|---|---|---|
| Atención mal registrada | Glosa por falta de soporte | Historia clínica completa y codificada |
| Datos del paciente errados | Rechazo de los RIPS | Verificar datos en la admisión |
| Tarifa distinta a la del contrato | Glosa por tarifas | Tarifario cargado según contrato |
| Digitar dos veces la información | Diferencias entre factura y RIPS | Un solo sistema para atención y facturación |
| Responder glosas tarde | Pérdida del valor glosado | Seguimiento con fechas y responsables |
Le explicamos los errores más frecuentes en ¿por qué tus facturas rebotan? y en RIPS como soporte de la factura electrónica.
Indicadores para medir el proceso de facturación en servicios de salud
- Porcentaje de RIPS rechazados en la validación.
- Días entre la atención y la radicación.
- Porcentaje de glosa sobre lo facturado.
- Días de cartera por pagador.
- Valor recuperado en respuestas a glosas.
Proceso de facturación en servicios de salud sin reprocesos con Clinova PRO
Clinova PRO conecta la atención con el cobro en un solo flujo:
- Atención: el médico registra la atención en la historia clínica electrónica.
- FEV + RIPS: se generan la factura electrónica y los RIPS en formato JSON.
- Validación: envío al Ministerio de Salud y CUV automático.
- Cobro: la cuenta queda lista para el pago, con CUV y CUCON.
Además incluye gestión de tarifas, cobros en recepción, documentos soporte, nómina electrónica y reportes de RIPS, y detecta errores en los RIPS antes de presentarlos al Ministerio. Conozca el módulo de RIPS y facturación electrónica.
Preguntas frecuentes
¿Cuáles son los pasos del proceso de facturación en servicios de salud?
Contrato, admisión, atención y registro, factura electrónica y RIPS, validación ante el Ministerio, radicación con soportes, gestión de devoluciones y glosas, y pago con conciliación.
¿Qué es el CUV?
El Código Único de Validación que entrega el Ministerio de Salud cuando los RIPS y la factura pasan las validaciones.
¿Qué es el CUCON?
El código único del contrato que introdujo la Resolución 948 de 2026. Se genera al cargar el contrato en el SIIFA.
¿Qué norma regula las glosas en salud?
La Resolución 2284 de 2023, que adoptó el Manual Único de Devoluciones, Glosas y Respuestas.
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Contenido informativo para prestadores de servicios de salud en Colombia, actualizado al 16 de octubre de 2026. No constituye asesoría jurídica ni contable. Fuentes: Decreto 441 de 2022, Resolución 948 de 2026 y Resolución 2284 de 2023 del Ministerio de Salud. Consulte los documentos técnicos vigentes en el micrositio del SISPRO.